Анализ положения сельскохозяйственного сектора экономики Казахстана свидетельствует, что одной из основных причин малой прибыльности этой сферы является низкий уровень развития и внедрения современной агротехнологии и технологий переработки сельскохозяйственной продукции. Интенсификация производства не реальна без использования и внедрения, трансферта инновационных технологий современных достижений науки, цифровых решений, международного обмена.

НАО НАНОЦ предлагает к внедрению ключевые инновации:

• адаптивно-ландшафтная система земледелия и технологии возделывания сельскохозяйственных культур на богарных и орошаемых землях юга и юго-востока РК;
• технологии ведения точного земледелия;
• технологии производства органической продукции;
• диверсификация и биологизация растениеводства, ресурсосбережение и экология производства;
• технологии дифференцированное применение удобрений для зерновых культур в системе точного земледелия для юго-востока РК; 
• технологии ресурсо и водосберегающая технология возделывания сельскохозяйственных культур на основе современных способов капельного орошения и прямого посева;
• технологии получения экологически чистой (оргаичекой) сельскохозяйственной продукции;
• различные овощные и картофельные севообороты; системы применения удобрений и средства защиты растений против вредных организмов;
• беспересадочные технологии семеноводства двулетних овощных культур для семеноводческих хозяйств;
• производство элитных саженцев плодово-ягодных культур и винограда
• приемы сохранения и воспроизводства плодородия почв;
• технологии применения биоагентов против насекомых-вредителей сельскохозяйственных культур;
• проектирование «под ключ» и науно-технологическое сопровождение комплексной технологии создания интенсивного плодового сада;
• технология феромоновой дезориентации вредных организмов сельскохозяйственных культур;
• биологические средства защиты сельскохозяйственных культур;
• создание оазисов, буферных лесополос вокруг садов и виноградников, для устройства ветроломов с применением гибридов тополя;
• организация производства элитных саженцев коммерчески ценных видов и гибридов тополя на основе использования эффективных технологий микроклонирования, контейнерного культивирования, с интегрированной системой защиты;
• технологии по защите хранилищ от вредителей и болезней запасов зерновых культур регулируемыми газовыми средами;
• инновационная технология возделывания и  интегрированная система защиты сои;
• технология прогнозирования и определения сроков обработок против яблонной  плодожорки и парши яблони с помощью разработанных метеостанций в режиме реального времени;
• технология  направленного выращивания молодняка, оптимального эффективного способа содержания, доения коров;
• технологии создания семейных молочно-товарных ферм до 100 голов КРС;
• технологии искусственного осеменения маточного поголовья КРС молочного направления;
• автоматизация подбора семени быка-производителя молочного скота для повышения молочной продуктивности и экстерьерных качеств скота;
• рецептуры сбалансированных рационов  кормления для пород молочного направления с учетом местных климатических и кормовых условий региона;
• интенсивная технология выращивания молодняка крупного рогатого скота молочного направления продуктивности;
• технология адаптированных схем зеленого конвейера, пастбищеоборота по созданию устойчивой кормовой базы;
• автоматизация расчёта индексов племенной ценности мясного скота;
• аакцины и диагностикумы против заболеваний сельскохозяйственных животных;
• стратегии по обеспечению ветеринарного благополучия сельскохозяйственных животных в крестьянских и фермерских хозяйствах;
• технологии автоматического учета животных
• технология автоматизации управления процессами вододеления и водоучета;
• технология использования грунтовых вод на субирригацию
• технология использования коллекторно-дренажных вод на орошени
• технология рассоления засоленных почв
• создано более 550 сортов и гибридов сельскохозяйственных культур. В настоящее время допущено к использованию в производстве РК и за ее пределами 162 сортов и гибридов, из них 153 в РК, в том числе: 28 – озимой пшеницы и тритикале, 28 – кукурузы, 24 – яровой пшеницы, 19 – ячменя, 19 – кормовых, многолетних трав, 17 – зернобобовых, 6 – овса, 5 – сахарной свеклы, 4 – риса, 3 – масличных.
• генофонд овощебахчевых культур составляет 12000 образцов 157 видов овощных культур из 100 стран мира. В тоже время, генофонд картофеля составляет 2100 образцов мировой коллекции из 40 стран мира.